Robust estimation of stochastic dynamics from tracked data

Výzva	Štipendiá pre excelentných výskumníkov a výskumníčky R2-R4
Hlavný riešiteľ	Katarína Boďová
Prijímateľ	Univerzita Komenského v Bratislave
Celkový rozpočet	219 514,80 €
Príspevok poskytovateľa	219 514,80 €
Zdroj financovania	Plán obnovy a odolnosti
Začiatok realizácie	september 2024
Koniec realizácie	august 2026
Kategória výskumníka	R3
Vedná oblasť	Fyzikálne, technické vedy a matematika

Anotácia

Nedávne pokroky v experimentálnych biologických technikách priniesli bohaté súbory údajov, ktoré nám umožňujú pochopiť zložitú dynamiku, ktorou sa riadia biologické procesy. Rozlúštenie interakcií medzi základnými komponentmi však predstavuje inverzný problém, pričom výzva spočíva v oddelení systematických dynamických komponentov od prirodzenej stochasticity a nevyhnutných chýb merania. Zatiaľ čo v literatúre je množstvo inverzných metód, často majú spoločné obmedzenie – vyžadujú si mimoriadne veľké súbory údajov. Naše zameranie sa sústreďuje na zlepšenie existujúcej metódy vyvinutej spoločnosťou Frishman & Ronceray v roku 2020, ktorá je známa svojim potenciálom zmierniť tieto požiadavky na údaje. Ak chcete použiť túto metódu na scenáre, ako je populačná genetika, ktorá sa vyznačuje riedkym vzorkovaním údajov, musíme ju spresniť pre takúto vzácnosť. Okrem toho máme v úmysle odvodiť presné odhady intervalov spoľahlivosti pre odvodené dynamické miery, čo je úloha, ktorá ešte nebola preskúmaná. Prostredníctvom vystavenia tejto rafinovanej metódy údajom z reálneho sveta je naším cieľom ukázať jej schopnosť extrahovať zmysluplné poznatky zo zložitosti biologickej dynamiky.