Development of an aptamer-based approach for studying flax fibre cell wall diversity

Výzva	Štipendiá pre excelentných výskumníkov a výskumníčky R2-R4
Hlavný riešiteľ	Ľubomír Harenčár
Prijímateľ	Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV
Celkový rozpočet	148 306,80 €
Príspevok poskytovateľa	148 306,80 €
Zdroj financovania	Plán obnovy a odolnosti
Začiatok realizácie	júl 2024
Koniec realizácie	jún 2026
Kategória výskumníka	R2
Vedná oblasť	Prírodné a lekárske vedy

Anotácia

Jednou z možných stratégií udržateľnosti je nájsť nové spôsoby využitia nedocenených pôvodných plodín, čo si vyžaduje nové analytické prístupy. Linum usitatissimum L., ako viacúčelová plodina úzko spätá so slovenskou kultúrou, je vhodným kandidátom na opis vlastností bunkovej steny vlákna pomocou aptamérov. Na hodnotenie biodiverzity ľanu, ako aj na charakterizáciu vlastností bunkovej steny už boli použité rôzne analýzy. Stále však existuje nedostatok nových účinných nástrojov na zodpovedanie otázok: čo odlišuje priadny a olejný typ ľanu a akú úlohu v tomto rozdiele zohráva zloženie a štruktúra bunkovej steny? Tieto odpovede sú dôležité nielen pre biológiu rastlín, keďže ľanové vlákno je skvelým príkladom nekonvenčnej bunkovej steny, ale aj pre výrobu vysokokvalitného ľanového vlákna, najmä v dvojúčelových odrodách. Súčasné molekulárne sondy pre analýzu bunkovej steny majú obmedzenia v oblasti presného zacielenia širokej škály štruktúr. Aptaméry, krátke jednovláknové molekuly DNA alebo RNA, sú syntetizované in vitro prostredníctvom SELEX (systematického vývoja ligandov exponenciálnym obohatením). Zatiaľ čo sú vo veľkej miere aplikované v biomedicínskom a environmentálnom výskume, ich použitie vo výskume bunkovej steny je len v začiatkoch. Cieľom tohto projektu je vyvinúť nové respektíve vybrať známe aptaméry, špecifické pre bunkovú stenu ľanového vlákna, ktoré sú schopné odlíšiť priadny typ ľanu od olejného, ako aj kvantifikovať a opísať vlastnosti bunkovej steny ľanu. Kľúčové slová: Syntéza, modifikácia a metabolizmus uhľohydrátov; Aplikované genetické inžinierstvo, transgénne organizmy, rekombinantné proteíny, biosenzory; Poľnohospodárstvo v súvislosti s rastlinnou výrobou, aplikovaná biológia rastlín; Linum usitatissimum L.; Aptamér