Integrative Bioinformatics Analysis of Next Generation Sequencing Data for Advanced Plant Research

Výzva	Štipendiá pre excelentných výskumníkov a výskumníčky R2-R4
Hlavný riešiteľ	Marek Šlenker
Prijímateľ	Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV
Celkový rozpočet	111 230,10 €
Príspevok poskytovateľa	111 230,10 €
Zdroj financovania	Plán obnovy a odolnosti
Začiatok realizácie	júl 2024
Koniec realizácie	jún 2026
Kategória výskumníka	R2
Vedná oblasť	Prírodné a lekárske vedy

Anotácia

Rýchly pokrok v botanike, najmä v oblasti fylogenézy rastlín a skúmania pôvodu polyploidných druhov možno bezpochyby pripísať rozšírenej aplikácii metód sekvenovania novej generácie (NGS) v posledných rokoch a súčasnému rozvoju bioinformatických nástrojov určených na spracovanie týchto údajov. Aj keď sú tieto metódy univerzálne a široko použiteľné, čoraz viac sa dostáva do popredia potreba prístupov, ktoré zohľadňujú jedinečné vlastnosti študovaných druhov rastlín. Hlavným cieľom tohto projektu je poskytnúť inovatívne bioinformatické riešenia šité na mieru na analýzu NGS dát a získať odpovede na špecifické vedecké otázky. Vyvinuté skripty a nástroje budú verejne sprístupnené, čím sa uľahčí ich použitie iným výskumníkom v ich štúdiách, a zároveň to umožní prípadné úpravy na zabezpečenie ďalšieho vývoja.