Origin, Lineage and Function of Novel Meningeal Lyve-1 positive Macrophages

Výzva	Štipendiá pre excelentných výskumníkov a výskumníčky R2-R4
Hlavný riešiteľ	Mária Mastihubová
Prijímateľ	Chemický ústav Slovenskej akadémie vied
Celkový rozpočet	219 514,80 €
Príspevok poskytovateľa	219 514,80 €
Zdroj financovania	Plán obnovy a odolnosti
Začiatok realizácie	september 2024
Koniec realizácie	august 2026
Kategória výskumníka	R3
Vedná oblasť	Prírodné a lekárske vedy

Anotácia

Glykozylácia ľudských proteínov je jednou z ich najčastejších a zároveň najvýznamnejších posttranslačných modifikácií, ovplyvňujúcich ich funkciu a vlastnosti. Zmenená glykozylácia bola pozorovaná pri mnohých patologických stavoch, ako najmä u primárnych (vrodených) poruchách glykozylácie, ale aj rôznych civilizačných ochorení, ako napríklad rakovina, kedy je pôvod pozorovanej aberantnej glykozylácie sekundárnej príčiny. Preto popri tradičnej analýze DNA a proteínov aj glykány môžu byť relevantným zdrojom pre vyhľadávanie nových potenciálnych biomarkerov týchto ochorení. Podľa všeobecnej biochemickej dogmy glykozylačný proces prebieha v endoplazmatickom retikule a Golgiho aparáte. Špecifický profil glykánov sa však mení veľmi dynamicky, bez jasne definovaného templátu a v závislosti od celkovej homeostázy jedinca. K signifikantným zmenám v glykoprofile môže dochádzať aj oveľa rýchlejšie, než je samotný polčas rozpadu jednotlivých proteínov uvoľnených po ich syntéze do extracelulárneho priestoru. Naše prvotné experimenty, v súlade s publikovanou literatúrou, naznačujú pravdepodobnú existenciu dynamických extracelulárnych glykozylačných mechanizmov, ktoré však nie sú stále dôkladnejšie preskúmané. Hlavným zameraním predkladaného projektu je štúdium glykozylačných mechanizmov a zmien počas patologických procesov, pričom modelovými materiálmi budú vzorky krvného séra od pacientov s primárnymi poruchami glykozylácie, nosiacimi patogénne mutácie v špecifických glykozylačných enzýmoch, ako aj od pacientov s kolorektálnym karcinómom odobraté pred a po chirurgickom zákroku. Okrem samotného ochorenia bude študovaný vplyv fixných biografických faktorov, ako veková kategória či pohlavie, na heterogenitu celkového glykoprofilu. Robustná infraštruktúra na báze hmotnostnej spektrometrie s možnosťou semiautomatizácie vo vysokopriepustnom formáte umožňuje tvorbu presných a obsiahlych dátových súborov, ktorých následné spracovanie napomôže k objasneniu molekulárnej podstaty týchto ochorení, identifikácii panelu nových potenciálnych glykobiomarkerov, ako aj ku štúdiu a bližšej charakterizácii základných, ako aj doposiaľ neobjasnených glykozylačných mechanizmov.