The environmental DNA-based detection of Trichobilharzia spp., parasitic agents of the cercarial dermatitis.

Výzva	Štipendiá pre excelentných výskumníkov a výskumníčky R2-R4
Hlavný riešiteľ	Daniel Barčák
Prijímateľ	Parazitologický ústav Slovenskej akadémie vied
Celkový rozpočet	148 306,80 €
Príspevok poskytovateľa	148 306,80 €
Zdroj financovania	Plán obnovy a odolnosti
Začiatok realizácie	september 2024
Koniec realizácie	august 2026
Kategória výskumníka	R2
Vedná oblasť	Prírodné a lekárske vedy

Anotácia

Bezpečné životné prostredie je v 21. storočí oprávnene považované za základnú požiadavku pre život a to hlavne vo vyspelých krajinách. Napriek tomu však existujú hrozby, ktoré stále pretrvávajú aj v niektorých európskych krajinách. Jednou z nich je parazitárne ochorenie známe ako cerkáriová dermatitída, ktoré spôsobujú voľne plávajúce larvy vtáčích schistozóm. K infekcii ľudí dochádza počas pobytu vo vode a prejavuje sa prevažne svrbivými kožnými léziami, u citlivých osôb aj vážnejšími symptómami. Výskyt týchto parazitov je monitorovaný vo väčšine krajín strednej Európy, no o ich rozšírení a druhovej diverzite na Slovensku neexistujú takmer žiadne údaje. Okrem toho je ich skríning založený hlavne na zdĺhavom zbere medzihostiteľov, vodných slimákov, a ich náročnom laboratórnom vyšetrení. Projekt TrEnD navrhuje inovatívnu metódu detekcie schistosóm rodu Trichobilharzia pomocou odberu environmentálnych vzoriek vody, postupu tzv. metabarkódovania a Next Generation sekvenovania. Hlavnými cieľmi sú (1) optimalizácia tejto techniky na vybranej lokalite v Košiciach (Slovensko), kde bol parazit už predtým potvrdený tradičnými metódami, (2) použitie optimalizovaného protokolu na odhalenie faktorov prostredia, ktoré ovplyvňujú distribúciu cerkárií a odhad zdravotného rizika pre ľudí, a (3) zvýšenie povedomia verejnosti na Slovensku o cerkáriovej dermatitíde. Zainteresované strany projektu TrEnD sú vedecká komunita, zdravotné inštitúcie a aj široká verejnosť. Výskumné skupiny zapojené do štúdia vtáčích schistomozóm alebo blízko príbuzných taxónov získajú rýchly, efektívny a neinvazívny nástroj na skríning distribúcie a druhovej diverzity týchto parazitov. Štandardizáciou tejto metódy vznikne jednoduchý nástroj, ktorý bude použiteľný úradmi verejného zdravotníctva na rutinné monitorovanie kvality povrchových vôd. Verejnosť získa dôležité informácie o nepríjemnom parazitickom ochorení, jeho klinických príznakoch a rizikových faktoroch, ktoré zvyšujú pravdepodobnosť nákazy. Projekt TrEnD bude navyše významným stimulom pre moju vedeckú kariéru a zároveň pomôže zaviesť túto modernú metódu v Parazitologickom ústave v Košiciach