Understandingthe role of alternative splicing in cisplatin resistance

Výzva	Štipendiá pre excelentných výskumníkov a výskumníčky R2-R4
Hlavný riešiteľ	Lucia Borszéková Pulzová
Prijímateľ	Biomedicínske centrum Slovenskej akadémie vied
Celkový rozpočet	135 947,90 €
Príspevok poskytovateľa	135 947,90 €
Zdroj financovania	Plán obnovy a odolnosti
Začiatok realizácie	september 2024
Koniec realizácie	jún 2026
Kategória výskumníka	R2
Vedná oblasť	Prírodné a lekárske vedy

Anotácia

Cisplatina patrí medzi vysoko účinné širokospektrálne chemoterapeutiká. Získaná rezistencia je hlavnou príčinou zlyhania terapie u pôvodne citlivých nádorov semenníkov tvorených zárodočnými bunkami (TGCTs). Aberantný alternatívny zostrih (AZ) molekuly pre-mRNA je sprievodným javom pri vývoji nádorov, progresii, metastázovaní a pravdepodobne zohrávajú úlohu aj pri vzniku rezistencie. Napriek pokroku technológii RNA-sekvenovania, zostáva úloha AZ vo vývoji chemorezistencie naďalej nedostatočne preskúmaná. Cieľom projektu je identifikácia biomarkerov (varianty AZ), ktoré sú schopné predikovať citlivosť na cisplatinu u TGCTs a pochopiť úlohu AZ vo vývoji rezistencie. Pomocou sekvenovania transkriptómu a in silico analýzy dát budú definované AZ charakteristík rezistentného fenotypu a taktiež bude študovaný aj vplyv AZ na expresiu génov a proteínových izoforiem. Na stanovenie vplyvu AZ na prežívanie buniek po terapii, budú využité inhibítory zostrihu a gene silencing regulátorov zostrihu.